RESUMEN: El rió Magdalena es uno de los afluentes más importantes del país, convirtiéndose en el eje fundamental de desarrollo nacional. Sin embargo, este afluente se ve afectado por la desembocadura del río Bogotá, el cual es un importante tributario que presenta una de las estructuras económicas más diversificadas, la cual está estrechamente ligada al uso de sus recursos naturales, así como al desarrollo de actividades agrícolas , mineras y procesos de transformación industrial, que han deteriorado el ecosistema, produciendo cambios sustanciales de las características propias de un río de alta montaña y convirtiéndolo en uno de lo más contaminados de sur América. El ecosistema en estudio es la zona de confluencia del río de Bogotá y el Magdalena razón por la cual la investigación se llevó a cabo, específicamente en la cuenca baja, ya que allí hay pocos estudios que proporcionen datos acerca de la calidad del agua en la desembocadura, lugar donde se concentra la contaminación más alta acumulada a lo largo de su recorrido. Por lo tanto, el objeto del presente proyecto es conocer el efecto de los vertimientos provenientes del cauce natural del río Bogotá sobre el río Magdalena. Para ello, se realizaron muestreos de agua para estudios de parámetros físicos, químicos, microbiológicos y biológicos en 4 puntos de la zona de confluencia, en dos épocas climáticas del año; una seca y otra lluviosa. En cada punto se tomaron muestras de agua para analizar Temperatura, Ph, Turbiedad, alcalinidad, Fosfatos, Nitratos, Materia Orgánica, DBO5, OD, Amonio, Coliformes totales y fecales. En cuanto al muestreo de macroinvertebrados se realizó mediante los métodos de colecta manual y red surber, mientras que para la colecta de fitoplancton y zooplancton, se usaron redes de plancton con las cuales se hizo arrastre horizontal. Mediante el análisis de componentes principales se establece que las variables que influenciaron la presente investigación fueron los nitratos y fosfatos, mostrando un comportamiento diferente en los dos ríos. Además, se confirma que los macroinvertebrados y el plancton presente, están estrechamente relacionados con las condiciones fisicoquímicas actuales. Finalmente se concluye que el río Bogotá tiene un efecto negativo sobre el río Magdalena al alterar las variables fisicoquímicas del agua, deteriorando la calidad del recurso hídrico y por lo tanto disminuyendo las comunidades hidrobiológicas propias de esta fuente hídrica, permitiendo solo el establecimiento de organismos tolerantes a estos escenarios. Al no ser tan significativa la alteración se demuestra que el Magdalena, aún tiene la capacidad de diluir el elevado grado de contaminación que recibe. ABSTRACT: The Magdalena River is one of the most important tributaries of the country, becoming the fundamental axis of national development. However, this tributary is affected by the Bogotá River mouth, which is an important tributary that presents one of the one of the most diversified economic structures, which is closely linked to the use of its natural resources, as well as to the development of agricultural activities, mining and industrial transformation processes, which have deteriorated the ecosystem, producing substantial changes in the characteristics of a high mountain river and making it one of the most polluted in South America. The ecosystem under study is the confluence zone of the Bogotá and Magdalena rivers. To do this, water samples were taken for studies of Physical, chemical microbiological and biological parameters in 4 points of the confluence zone, in two climatic seasons of the year; one dry and one rainy. At each point, water samples were taken to analyze temperature, Ph, Turbidity, Alkalinity, Phosphates, Nitrates, Organic matter, BOD5, OD, Ammonium, total and fecal Coliforms. The sampling of macroinvertebrates was carried out by means of manual collection methods and the surber network, while, for the collection of phytoplankton and zooplankton, plankton nets were used with which horizontal trawling was done. By means of the analysis of main components it is established that the variables that influenced the present investigation were nitrates and phosphates, showing a different behavior in the two rivers. In addition, it is confirmed that the macroinvertebrates and the present plankton are closely related to the current physicochemical conditions. Finally, it is concluded that the Bogotá River has a negative effect on the Magdalena River by altering the physicochemical variables of the water, deteriorating the quality of the water resource and therefore diminishing the communities of this water source, allowing only the establishment of tolerant organisms to the scenarios. As the alteration is not so significant, it is shown that the Magdalena still has the capacity to dilute the high degree of contamination it receives.Seccional Girardot