La presente investigación tuvo como objetivo determinar la presencia de Colletotrichum spp., en estado quiescente de flores y frutos de mora (Rubus glaucus Benth). Para ello, se realizaron colectas de flores y frutos asintomáticos de cultivos en etapa productiva de los departamentos de Cundinamarca, Santander y Antioquia, las cuales fueron procesadas y colocadas en cámaras húmedas con el fin de detectar infecciones quiescentes mediante la formación de acérvulos. Al cabo de ocho y 15 días (estados IV, V, VI; y I, II, III respectivamente) se identificaron los primeros síntomas de antracnosis y signos característicos del patógeno en todas las estructuras. Sin embargo, estadísticamente se observaron diferencias significativas en la incidencia de infecciones quiescentes en los seis estados fenológicos del botón floral de mora; además, se evidenció mayor presencia de la enfermedad en los dos primeros estados. Se estableció una colección de estudio la cual se conformó con 63 aislamientos de Colletotrichum spp., obtenidos a partir de la siembra de acérvulos presentes en cada uno de los órganos. A cada colonia se le realizaron pruebas de identificación con medios selectivos para diferenciar entre especies de Colletotrichum; y posteriormente su respectiva caracterización morfológica a nivel macroscópico y microscópico, obteniendo como resultado la identificación de 61 aislamientos, los cuales posiblemente pertenecen al complejo de especies de Colletotrichum acutatum y dos a la especie Colletotrichum gloeosporioides. La patogenicidad de los aislamientos seleccionados se evaluó inoculando discos de agar sobre los seis estados fenológicos del botón floral de mora, demostrando que todos los aislamientos causaron infección en esas estructuras; sin embargo, el aislamiento C4EF: V presentó mayor colonización de acérvulos y por ende, necrosis del tejido con mayor rapidez con respecto a los demás tratamientos.